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创三甲专栏∣金医科研:我院李炳团队通过机器学习联合表达谱芯片数据构建阿尔茨海默病的诊断预测模型筛选潜在的生物标志物
发布日期:2022-12-14 来源: 浏览量: 打印

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我院临床医学研究中心李炳副研究员团队的最新研究成果Integrated bioinformatics-based identification of diagnostic markers in Alzheimer disease于2022年11月10日发表在Frontiers in Aging Neuroscience杂志上(IF=5.702)。

该研究通过机器学习构建了阿尔茨海默病(AD)的诊断预测模型,发现SYP和RGS4可作为AD潜在的诊断标志物,并且与AD发病过程中的免疫微环境及神经炎症的密切相关,为AD的诊断和免疫治疗提供新的靶点。

研究背景

阿尔茨海默病的诊断主要基于Aβ淀粉样斑块形成和tau蛋白过度磷酸化的神经原纤维缠结的病理改变。AD中Aβ和神经原纤维缠结渐进性积累的机制尚不清楚。研究表明免疫细胞参与AD发生发展过程中的神经炎症和Aβ清除。因此,识别新的分子标志物用于AD的早期诊断,阐明免疫细胞在AD发病中的作用非常重要。

研究发现

本研究共筛选出107个AD相关的差异表达基因,其中上调28个,下调79个。通过随机森林树算法构建了AD诊断预测模型,筛选出AD潜在的诊断标志物突触素(SYP)和G蛋白信号调节因子4 (RGS4)。在外部数据集中,ROC曲线分析验证了SYP联合RGS4具有较高的诊断价值(ROC曲线下面积= 0.909)。此外,免疫细胞浸润分析结果发现自然杀伤细胞、B细胞、单核细胞、内皮细胞和成纤维细胞与AD的发生发展有关,并且SYP和RGS4的表达水平与这些免疫细胞浸润程度呈负相关,提示SYP和RGS4可能通过影响免疫微环境参与AD的发病。

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本研究成果是在国家自然科学基金面上项目82174522的资助下完成。复旦大学附属金山医院硕士研究生陈丹梅为该论文的共同第一作者,复旦大学附属金山医院临床研究中心李炳研究员为通讯作者。

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